据参考消息7月12日报道，美国政府对爱泼斯坦案的调查处理方式，导致美国司法部和联邦调查局（FBI）官员产生分歧。
报道称7月11日，FBI副局长邦吉诺曾与司法部长邦迪就此案产生“激烈冲突”，正考虑辞职。
FBI局长帕特尔否认将因此案辞职，另有司法部官员否认了两个部门由此案出现裂痕的说法。
据《卫报》7月13日报道，帕特尔表示，有关“FBI希望公布更多信息但被司法部拦住”的“阴谋论不是真的，很荣幸能为美国总统效劳，只要他需要，我就会继续这么做。”
美国司法部副部长布兰奇（Todd Blanche）否认了FBI和司法部领导层因此案出现裂痕的说法。他在社交平台上发文称：“我与帕特尔、邦吉诺，就FBI和司法部有关爱泼斯坦案的档案备忘录密切合作，我们所有人都签署了备忘录的内容及其陈述的结论。”
根据这份备忘录，调查方发现了超过300GB与爱泼斯坦案相关的数据和实物证据，包括“大量爱泼斯坦的图像、未成年或疑似未成年受害者的图像和视频、非法的儿童性虐待材料等”。
一名知情人士表示，在备忘录的内容和是否发布问题上，FBI和司法部高层原本意见一致，但自从外界作出强烈反应以来，邦吉诺已试图与司法部的回应保持距离。
今年2月，邦迪曾表示，“爱泼斯坦案的客户名单就放在我的桌上等待审查”。7月6日，FBI和司法部达成结论：没有证据表明已故富商爱泼斯坦曾敲诈权势人物。
2019年7月，爱泼斯坦因涉嫌合谋拐卖和性侵未成年女性被捕。他于同年8月在纽约一座监狱死亡，法医认定其死于自杀。爱泼斯坦与美国政商各界的权贵和名人交往甚广，曾购买美属维尔京群岛的一座私人岛屿，并在那里组织大规模未成年人性交易活动。相关丑闻一经披露，便引起轩然大波。